Genetic diversity among alfalfa genotypes (Medicago sativa L.) of non-dormant cultivars using SSR markers and agronomic traits
El objetivo de este trabajo consistió en determinar la diversidad genética en 40 individuos de alfalfa (Medicago sativa L.) de cinco cultivares de grado de reposo 8. Se evaluaron a campo la producción de forraje, la velocidad de rebrote y el comportamiento frente a tallo negro de primavera, ma...
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| Publicado en: | Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias |
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Alfalfa Análisis de clusters Análisis de componentes principales Análisis de Procrustes Generalizado Autotetraploide Autotetraploidy Cluster analysis Diversidad genética como recurso Fitomejoramiento Generalizes procrustes analysis Genetic diversity as resource Genotipos Genotypes Marcadores microsatélites Medicago sativa Mejoramiento vegetal Microsatellite marker Plant breeding Principal components analysis |
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Alarcón, Yanina Arolfo, Valeria Basigalup, Daniel H. Bruno, Cecilia Gieco, Jorge O. Grandón, Nancy G. Moreno, María V. Orodizzi, Ariel |
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Análisis de la diversidad genética en genotipos de alfalfa (Medicago sativa L.) sin dormición, mediante el uso de marcadores SSR y caracteres agronómicos Genetic diversity among alfalfa genotypes (Medicago sativa L.) of non-dormant cultivars using SSR markers and agronomic traits |
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Ciencias agrarias |
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El objetivo de este trabajo consistió
en determinar la diversidad genética en
40 individuos de alfalfa (Medicago sativa L.)
de cinco cultivares de grado de reposo 8. Se
evaluaron a campo la producción de forraje, la
velocidad de rebrote y el comportamiento frente
a tallo negro de primavera, mancha ocular y roya.
El análisis de la varianza se realizó mediante un
modelo lineal mixto para determinar la variación
agronómica entre los individuos. El análisis de
componentes principales se realizó a partir
de los datos agronómicos estandarizados. El
dendrograma agronómico se construyó a partir
del índice de Gower y el agrupamiento UPGMA.
Para la caracterización molecular se analizaron
seis marcadores SSR, con los cuales se
identificaron un total de 84 alelos. Las distancias
genéticas se calcularon con el índice de Nei
estándar. La diversidad genética promedio fue
de 0,843, indicando una alta variabilidad entre
los individuos evaluados. Por último, el análisis
de procrustes generalizado detectó un 65,4%
de consenso entre el ordenamiento agronómico
y el molecular. Este porcentaje probablemente
se relacione con el bajo número de individuos y
marcadores SSR analizados; sin embargo, este
estudio provee una línea de base para estudios
futuros de diversidad que permitirán identificar
individuos o cultivares genéticamente distantes. The aim of this study was to assess genetic diversity among 40 alfalfa (Medicago sativa L.) genotypes of different non-dormant (FD=8) cultivars. Biomass yield, regrowth speed and reaction to spring black stem, lepto leaf spot, and rust were evaluated. Analyses of variances were performed using a mixed model to examine the agronomic variation among individuals. A principal component analysis on standardized agronomic data was performed. Agronomic data were also used to calculate Gower's distance and UPGMA algorithm. For the molecular analysis, six SSR markers were evaluated and 84 alleles were identified. The genetic distance was estimated using standard Nei's distance. Average standard genetic diversity was 0.843, indicating a high degree of variability among genotypes. Finally, a generalized procrustes analysis was performed to calculate the correlation between molecular and agronomic distance, indicating a 65.4% of consensus. This value is likely related to the low number of individuals included in the study, which might have underestimated the real phenotypic variability among genotypes. Despite the low number of individuals and SSR markers analyzed, this study provides a baseline for future diversity studies to identify genetically distant alfalfa individuals or cultivars. |
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El objetivo de este trabajo consistió
en determinar la diversidad genética en
40 individuos de alfalfa (Medicago sativa L.)
de cinco cultivares de grado de reposo 8. Se
evaluaron a campo la producción de forraje, la
velocidad de rebrote y el comportamiento frente
a tallo negro de primavera, mancha ocular y roya.
El análisis de la varianza se realizó mediante un
modelo lineal mixto para determinar la variación
agronómica entre los individuos. El análisis de
componentes principales se realizó a partir
de los datos agronómicos estandarizados. El
dendrograma agronómico se construyó a partir
del índice de Gower y el agrupamiento UPGMA.
Para la caracterización molecular se analizaron
seis marcadores SSR, con los cuales se
identificaron un total de 84 alelos. Las distancias
genéticas se calcularon con el índice de Nei
estándar. La diversidad genética promedio fue
de 0,843, indicando una alta variabilidad entre
los individuos evaluados. Por último, el análisis
de procrustes generalizado detectó un 65,4%
de consenso entre el ordenamiento agronómico
y el molecular. Este porcentaje probablemente
se relacione con el bajo número de individuos y
marcadores SSR analizados; sin embargo, este
estudio provee una línea de base para estudios
futuros de diversidad que permitirán identificar
individuos o cultivares genéticamente distantes. |
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