Ordenaciones de material genético a partir de información multidimensional
New biotechnologies allow to obtain information for genetic characterization from multiple molecular and/or morphological markers. The ordination of genetic material through the exploration of variability patterns is addressed by multivariate methods. Dimension reduction techniques (DRT) and g...
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| Publicado en: | Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias |
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| Acceso en línea: | https://bdigital.uncu.edu.ar/fichas.php?idobjeto=6523 |
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Análisis de componentes principales Árboles de recorrido mínimo Biotecnología Escalamiento multidisciplinar Genética Material genético Multidimensional scaling Principal components analysis Procrustes |
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6130 78 Simposio y Congreso spa UNC_FCA_CEB UNC_FCA_CEB |
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Balzarini, Mónica Bruno, Cecilia |
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Ciencias agrarias |
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New biotechnologies allow to obtain information
for genetic characterization from multiple
molecular and/or morphological markers.
The ordination of genetic material through the
exploration of variability patterns is addressed
by multivariate methods. Dimension reduction
techniques (DRT) and graphic representation
are crucial to visualize multivariate data in lowdimensional
spaces since it facilitate the understanding
of relationships among individuals
and/or markers. The principal component
analysis, the multidimensional scaling and
generalized procrustes analysis are dimension
reduction techniques applicable to data from
molecular and/or morphological markers.
The minimum spanning trees and the biplots
are techniques that allow geometrical representations
of results from DRT. This paper
describes such techniques and its applications
are illustrated on a dataset with molecular and
morphological markers characterizing fungus
genetic material. Nuevas biotecnologías permiten obtener información para caracterizar materiales genéticos a partir de múltiples marcadores, ya sean éstos moleculares y/o morfológicos. La ordenación del material genético a través de la exploración de patrones de variabilidad multidimensionales se aborda mediante diversas técnicas de análisis multivariado. Las técnicas multivariadas de reducción de dimensión (TRD) y la representación gráfica de las mismas cobran sustancial importancia en la visualización de datos multivariados en espacios de baja dimensión ya que facilitan la interpretación de interrelaciones entre las variables (marcadores) y entre los casos u observaciones bajo análisis. Tanto el Análisis de Componentes Principales, como el Análisis de Coordenadas Principales y el Análisis de Procrustes Generalizado son TRD aplicables a datos provenientes de marcadores moleculares y/o morfológicos. Los Árboles de Mínimo Recorrido y los biplots constituyen técnicas para lograr representaciones geométricas de resultados provenientes de TRD. En este trabajo se describen estas técnicas multivariadas y se ilustran sus aplicaciones sobre dos conjuntos de datos, moleculares y morfológicos, usados para caracterizar material genético fúngico. |
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Ordenaciones de material genético a partir de información multidimensional Ordinations of genetic data from multidimensional markers |
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New biotechnologies allow to obtain information
for genetic characterization from multiple
molecular and/or morphological markers.
The ordination of genetic material through the
exploration of variability patterns is addressed
by multivariate methods. Dimension reduction
techniques (DRT) and graphic representation
are crucial to visualize multivariate data in lowdimensional
spaces since it facilitate the understanding
of relationships among individuals
and/or markers. The principal component
analysis, the multidimensional scaling and
generalized procrustes analysis are dimension
reduction techniques applicable to data from
molecular and/or morphological markers.
The minimum spanning trees and the biplots
are techniques that allow geometrical representations
of results from DRT. This paper
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